这里得说说巫教和炎黄集团所信仰宗教的分歧。
巫教是宗教的源头，各个民族都是首先产生了巫教，然后伴随着体制的确立，巫教才渐渐转变为宗教。
蒙古人、满人、日本和韩国人的萨满教，西藏的“密宗”，都受到巫教的影响。
和宗教相比，巫教更自由，更草根。
比如:宗教强调神绝对高于人，神总是高高在上，不轻易接触凡人，人必须服从神的命令，不能讨价还价。巫教虽然也认为神挺牛叉的，但并不完全绝对。人有时候可以跟神磨磨嘴皮子，讨价还价，有时候神受了人的供奉，得了好处，却拿钱不办事，会被人惩罚。神有时候也会来到人间，和人一起相处，“民神杂糅，无有严威”，这就是炎黄联盟讨伐九黎族的理由之一。
宗教祭祀庄严神圣，主要在庙堂举行仪式。巫教相反，祭祀要热闹奔放，在野外又唱又跳，一些人还要扮演神灵。
一般宗教的神都是固定的，神和人之间有不可跨越的鸿沟。巫教常常把自己的祖先也当神供奉，导致神的数量神满为患，有些神就分不清到底是神还是部落的祖先。这也是炎黄联盟诟病的理由，“烝享无度，民神同位”。
最后，宗教的神职人员都是经过严格筛选和培训考级，有从业职格证的。巫教的要求就很低了，家乡有时候也可以客串一下巫师。炎黄联盟就批评九黎族没有素质。
因为这时候的仰韶文化圈比大汶口文化圈历史更悠久，文明程度更高，在黄帝时期已经进入神圣的宗教阶段，所以，很是看不惯东夷集团这种野蛮混『乱』的巫教画风，就给九黎族立法，但是蚩尤不鸟他，所以说:“蚩尤不用帝命”。
这样就师出有名了，不管炎黄联盟是不是拿这个当开战的理由，总之，有了“涿鹿之战”。
蚩尤素有兵主神之称，战斗力无人可比，加上他手下有八十一个兄弟，个个身怀特异功能，骁勇善战。
开始炎黄联盟没有占到便宜，七十一战不胜。后来求告九玄天女，得到制胜三宝，即六甲六壬兵信符，制妖通灵印，九光玉节绝魔剑。九玄天女又派女魃相助，女魃法力了得，会使用气象武器，改变天气，再加上龙族、阐教的帮助，终于在涿鹿之战大败蚩尤，杀了蚩尤和他的八十一个兄弟。
据说，蚩尤被擒之地为绝辔之野，蚩尤割断缰绳，任由曾经驮载自己纵横天下的彪悍战马，在溅满鲜血遍地尸骸的荒原上踽踽独行，在残阳如血的黄昏，长啸悲鸣。中华五千年文明史上的第一场大战，就此落幕。
蚩尤被处死后，黄帝还是惧怕他强大的战斗力，担心他死后复活，将他的头和身体分别安葬在两个相距千里的地方。
蚩尤被杀后，九黎族一部留在原地，融入了华夏文化，一部分南迁，少部分流放北境。